Kỳ Lân Các có tất cả năm tầng.
Tầng thấp nhất là khu vực hoạt động của các chấp sự, chủ yếu phụ trách kiểm tra thân phận, thu thập tình báo, cũng như trông coi kho ngoài.
Lầu hai là công thự để các Thiên Hộ của Nam Bắc Trấn Phủ Ty giải quyết công vụ, lầu ba và lầu bốn phụ trách hội nghị, quyết sách và các việc cơ mật, đồng thời các cao tầng của Thiên Lân Vệ cũng làm việc tại đây.
Còn tầng cao nhất là Chỉ Huy Sứ Thự, chưa được cho phép, bất kỳ ai cũng không được tự tiện bước vào.
